Окончил Пекинский университет гражданского строительства и архитектуры. В 2002 году получил степень магистра архитектуры в Йельском университете.
Прежде чем создать собственную компанию, молодой дизайнер работал со студиями Zaha Hadid Architects в Лондоне и Eisenman Architects в Нью-Йорке, а также занимался преподавательской деятельностью.
Свою архитектурную студию MAD Architects Ма Яньсун основал 2004 году.
В 2010 году Ма Яньсун был избран почетным членом Британского королевского института архитекторов. В 2014 году он был включён в список «Молодых глобальных лидеров» Всемирного экономического форума. В том же году он также был включён знаменитым американским журналом Fast Company в сотню наиболее творческих бизнесменов 2014 года. Ма Яньсун – первый китайский архитектор, удостоившийся подобного признания.
Студия MAD Architects, где работает более 100 архитекторов, вошла в десятку наиболее креативных компаний Китая. Под руководством Ма Яньсуна MAD Architects разработала ряд оригинальных проектов, среди которых Музей нарративного искусства Джорджа Лукаса в Чикаго, башни «Абсолют Тауэрс» («башни Мэрилин Монро») в канадском городе Миссисога, музей в Ордосе, многофункциональный комплекс на окраине пекинского парка «Чаоян», объект «Hutong Bubble 32» в китайской столице.
Также является профессором Пекинского университета гражданского строительства и архитектуры.